FKIP Universitas Muslim Maros yang dinaungi oleh Yayasan Perguruan Islam Maros (YAPIM) sebagai penyelenggara pada awal mulanya berasal dari sekolah tinggi yang dibina oleh Yayasan Perguruan Islam Maros, yaitu: Sekolah Tinggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan (STKIP) YAPIM (berdiri pada tanggal 11 Oktober 1984 berdasarkan Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia, Nomor 093/D/O/1984).
Berdasarkan tuntutan kebutuhan pengembangan perguruan tinggi, maka pada tahun 2013 mulai diusahakan untuk melebur Sekolah Tinggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan (STKIP) YAPIM dengan dua Sekolah tinggi lainnya di bawah naungan YAPIM tersebut menjadi Universitas. Setelah berproses beberapa tahun, pada akhir tahun 2017 Kementerian Riset Teknologi dan Pendidikan Tinggi menyetujui perubahan bentuk tersebut dengan Nomor SK 578/KPT/I/2017 Tentang penggabungan Sekolah Tinggi Ilmu Manajemen, Sekolah TInggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan dan Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian menjadi Universitas Muslim Maros dan Sekolah Tinggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan(STKIP) YAPIM berubah menjadi FKIP Universitas Muslim Maros. Hingga saat ini, di FKIP Universitas Muslim Maros telah ditetapkan 6 Program Studi yaitu Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia (S1), Pendidikan Biologi (S1), Pendidikan Matematika (S1), Pendidikan Bahasa Inggris (S1), Pendidikan Fisika (S1) dan Pendidikan Bahasa Indonesia (S2).